SNP-analysis in certification and identification of maize lines

Authors

  • Т. М. Сатарова Державна установа Інститут сільського господарства степової зони НААН, Ukraine
  • Б. В. Дзюбецький Державна установа Інститут сільського господарства степової зони НААН, Ukraine
  • В. Ю. Черчель State authority Institute of steppe zone ariculture, National Academy of Agrarian Sciences, Ukraine
  • В. В. Борисова Державна установа Інститут сільського господарства степової зони НААН, Ukraine
  • М. М. Таганцова Ukrainian Institute for Plant Variety Examination, Ukraine

DOI:

https://doi.org/10.21498/2518-1017.3(24).2014.55993

Keywords:

SNP-marker, SNP-analysis, DNA certification, identification

Abstract

Methodical aspects of using the analysis of DNA single-nucleotide polymorphism (SNP-analysis) for certification and identification of maize lines are considered. It is shown that SNP-genotyping is a method with high discriminatory potential that can differentiate maize lines among themselves and is recommended to use for certification of maize  lines and analysis of their homogeneity, stability and genotype differences.

Downloads

Download data is not yet available.

Author Biographies

Т. М. Сатарова, Державна установа Інститут сільського господарства степової зони НААН

Т. М. Satarova

Б. В. Дзюбецький, Державна установа Інститут сільського господарства степової зони НААН

В. V. Dziubetskyi

В. Ю. Черчель, State authority Institute of steppe zone ariculture, National Academy of Agrarian Sciences

V. Yu. Cherchel

В. В. Борисова, Державна установа Інститут сільського господарства степової зони НААН

V. V. Borysova

М. М. Таганцова, Ukrainian Institute for Plant Variety Examination

М. М. Таgantsova

References

Syvänen A.-Ch. Assessing genetic variation: genotyping single nucleotide polymorphisms / A.- Ch. Syvänen // Nature reviews / Genetics. – 2001. – Vol. 2. – P. 930–942.

Vignal A. A review on SNP and other types of molecular markers and their use in animal genetics / A. Vignal, D. Milan, M. Sancristobal, A. Eggen // Genetics, selection, evolution. – 2002. – Vol. 34, No 3. – P. 275–305.

Ganal M. W. A large maize (Zea mays L.) SNP genotyping array: development and germplasm genotyping, and genetic mapping to compare with the B73 reference genome [Електронний ресурс] / M. W. Ganal, G. Durstewitz, A. Polley et al. // PLoS ONE. – 2011. – Vol. 6 (12). – Режим доступу : DOI: 10.1371/journal.pone.0028334.

Lu Y. Molecular characterization of global maize breeding germplasm based on genome-wide single nucleotide polymorphisms / Y. Lu, J. Yan, C. T. Guimaräes et al. // Theor. Appl. Genet. – 2009. – Vol. 120. – P. 93–115.

Сиволап Ю. М. Вариабельность и специфичность геномов сельскохозяйственных растений / Ю. М. Сиволап, Н. Э. Кожухова, Р. Н. Календарь. – Одеса : Астропринт, 2011. – 336 с.

Кожухова Н. Е. Геном кукурудзи та його поліпшення / Н. Е. Кожухова, Ю. М. Сиволап, Б. Ф. Вареник // Вісник аграрної науки. – 2011. – No 2. – С. 26–29.

Fan J. B. Illumina universal bead arrays / J. B. Fan, K. L. Gundersson, M. Bibikova et al. // Methods Enzymol. – 2006. – Vol. 410. – P. 57–73.

Murray M. G. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA / M. G. Murray, W. F. Thompson // Nucleic Acids Res. – 1980. – Vol. 8, No 19. – P. 4321–4326.

Методика проведення експертизи сортів кукурудзи звичайної (Zea mays L.) на відмінність, однорідність і стабільність [Електронній ресурс] / Український інститут експертизи сортів рослин / Державна система охорони прав на сорти рослин. – Режим доступу : http://sops.gov.ua/uploads/files/documents/Metodiki/909.pdf. – 38 c.

Лещук Н. Грунтовий та лабораторний сортовий контроль: роль і значення в сортовій сертифікації [Електронний ресурс] / Н. Лещук. – К., 2009. – Режим доступу : ldni.sumy.ua/POSTcjntrol.pps.

Сатарова Т. М. Паспорти ліній кукурудзи за молекулярно-біологічними показниками (SNP-паспорти) // Електронна база даних / Т. М. Сатарова, В. В. Борисова. – Дніпропетровськ : ДУ ІСГСЗ, 2013.

Методика проведення експертизи на відмінність, однорідність та стабільність (ВОС-тест) кукурудзи // Охорона прав на сорти рослин : офіц. бюлетень. – 2003. – No 2, Ч. 3. – С. 49–57.

Downloads

Published

2014-11-28

How to Cite

Сатарова, Т. М., Дзюбецький, Б. В., Черчель, В. Ю., Борисова, В. В., & Таганцова, М. М. (2014). SNP-analysis in certification and identification of maize lines. Plant Varieties Studying and Protection, (3(24), 4–9. https://doi.org/10.21498/2518-1017.3(24).2014.55993

Issue

No. 3(24) (2014)

Section

MOST TOPICAL ISSUES

License

Copyright (c) 2016 Plant varieties studying and protection

Creative Commons License

This work is licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License.

Our journal abides by the CREATIVE COMMONS copyright rights and permissions for open access journals.

Authors, who are published in this journal, agree to the following conditions:

1. The authors reserve the right to authorship of the work and pass the first publication right of this work to the journal under the terms of a Creative Commons Attribution License, which allows others to freely distribute the published research with the obligatory reference to the authors of the original work and the first publication of the work in this journal.

 2. The authors have the right to conclude separate supplement agreements that relate to non-exclusive work distribution in the form in which it has been published by the journal (for example, to upload the work to the online storage of the journal or publish it as part of a monograph), provided that the reference to the first publication of the work in this journal is included.