SNP-analysis in certification and identification of maize lines

Authors

  • Т. М. Сатарова Державна установа Інститут сільського господарства степової зони НААН, Ukraine
  • Б. В. Дзюбецький Державна установа Інститут сільського господарства степової зони НААН, Ukraine
  • В. Ю. Черчель State authority Institute of steppe zone ariculture, National Academy of Agrarian Sciences, Ukraine
  • В. В. Борисова Державна установа Інститут сільського господарства степової зони НААН, Ukraine
  • М. М. Таганцова Ukrainian Institute for Plant Variety Examination, Ukraine

DOI:

https://doi.org/10.21498/2518-1017.3(24).2014.55993

Keywords:

SNP-marker, SNP-analysis, DNA certification, identification

Abstract

Methodical aspects of using the analysis of DNA single-nucleotide polymorphism (SNP-analysis) for certification and identification of maize lines are considered. It is shown that SNP-genotyping is a method with high discriminatory potential that can differentiate maize lines among themselves and is recommended to use for certification of maize  lines and analysis of their homogeneity, stability and genotype differences.

Author Biographies

Т. М. Сатарова, Державна установа Інститут сільського господарства степової зони НААН

Т. М. Satarova

Б. В. Дзюбецький, Державна установа Інститут сільського господарства степової зони НААН

В. V. Dziubetskyi

В. Ю. Черчель, State authority Institute of steppe zone ariculture, National Academy of Agrarian Sciences

V. Yu. Cherchel

В. В. Борисова, Державна установа Інститут сільського господарства степової зони НААН

V. V. Borysova

М. М. Таганцова, Ukrainian Institute for Plant Variety Examination

М. М. Таgantsova

References

Syvänen A.-Ch. Assessing genetic variation: genotyping single nucleotide polymorphisms / A.- Ch. Syvänen // Nature reviews / Genetics. – 2001. – Vol. 2. – P. 930–942.

Vignal A. A review on SNP and other types of molecular markers and their use in animal genetics / A. Vignal, D. Milan, M. Sancristobal, A. Eggen // Genetics, selection, evolution. – 2002. – Vol. 34, No 3. – P. 275–305.

Ganal M. W. A large maize (Zea mays L.) SNP genotyping array: development and germplasm genotyping, and genetic mapping to compare with the B73 reference genome [Електронний ресурс] / M. W. Ganal, G. Durstewitz, A. Polley et al. // PLoS ONE. – 2011. – Vol. 6 (12). – Режим доступу : DOI: 10.1371/journal.pone.0028334.

Lu Y. Molecular characterization of global maize breeding germplasm based on genome-wide single nucleotide polymorphisms / Y. Lu, J. Yan, C. T. Guimaräes et al. // Theor. Appl. Genet. – 2009. – Vol. 120. – P. 93–115.

Сиволап Ю. М. Вариабельность и специфичность геномов сельскохозяйственных растений / Ю. М. Сиволап, Н. Э. Кожухова, Р. Н. Календарь. – Одеса : Астропринт, 2011. – 336 с.

Кожухова Н. Е. Геном кукурудзи та його поліпшення / Н. Е. Кожухова, Ю. М. Сиволап, Б. Ф. Вареник // Вісник аграрної науки. – 2011. – No 2. – С. 26–29.

Fan J. B. Illumina universal bead arrays / J. B. Fan, K. L. Gundersson, M. Bibikova et al. // Methods Enzymol. – 2006. – Vol. 410. – P. 57–73.

Murray M. G. Rapid isolation of high molecular weight plant DNA / M. G. Murray, W. F. Thompson // Nucleic Acids Res. – 1980. – Vol. 8, No 19. – P. 4321–4326.

Методика проведення експертизи сортів кукурудзи звичайної (Zea mays L.) на відмінність, однорідність і стабільність [Електронній ресурс] / Український інститут експертизи сортів рослин / Державна система охорони прав на сорти рослин. – Режим доступу : http://sops.gov.ua/uploads/files/documents/Metodiki/909.pdf. – 38 c.

Лещук Н. Грунтовий та лабораторний сортовий контроль: роль і значення в сортовій сертифікації [Електронний ресурс] / Н. Лещук. – К., 2009. – Режим доступу : ldni.sumy.ua/POSTcjntrol.pps.

Сатарова Т. М. Паспорти ліній кукурудзи за молекулярно-біологічними показниками (SNP-паспорти) // Електронна база даних / Т. М. Сатарова, В. В. Борисова. – Дніпропетровськ : ДУ ІСГСЗ, 2013.

Методика проведення експертизи на відмінність, однорідність та стабільність (ВОС-тест) кукурудзи // Охорона прав на сорти рослин : офіц. бюлетень. – 2003. – No 2, Ч. 3. – С. 49–57.

Published

2014-11-28

How to Cite

Сатарова, Т. М., Дзюбецький, Б. В., Черчель, В. Ю., Борисова, В. В., & Таганцова, М. М. (2014). SNP-analysis in certification and identification of maize lines. Plant Varieties Studying and Protection, (3(24), 4–9. https://doi.org/10.21498/2518-1017.3(24).2014.55993

Issue

Section

MOST TOPICAL ISSUES

Most read articles by the same author(s)